Müşterilerin, borcuna mahsuben verdiği, kendisine veya diğer bir üçüncü şahıslara ait, gerektiğinde çeki alan firmanın da borcuna mahsuben üçüncü şahıslara ciro edeceği çeklere Müşteri Çeki denir. Müşteri Çekleri modülü; cari hesaplardan alınan çekleri, yine cari hesaplara ciro etmek ve çeki veren kişiye iade etmek ya da bankaya tahsile/teminata göndermek için kullanılır. Bu modülde bulunan raporlar ile, müşteri çeklerine ilişkin bilgiler raporlanır.