Muhasebe modülü; şirketin, Genel Muhasebe işlemleriyle ilgili hesap planı ve günlük fiş kayıtlarının girilmesini, izlenmesini, ay ve gün mizanlarının ve kanuni defter dökümlerinin alınmasını sağlayan modüldür. Muhasebe programı diğer bölümlerle entegre kullanılmıyorsa veya sadece muhasebe programı kullanılıyorsa, günlük kayıtları oluşturmak için kullanılır. Entegre kullanımda ise, program tarafından oluşturulacak günlük kayıtların izlenmesi, düzenlenmesi ve raporlarının alınması için yine bu bölümün kullanılması gerekir. Entegrasyon Modülü kullanılıyorsa, ön muhasebe ile ilgili modüllerden Entegrasyon Modülüne işlenen kayıtlar yine bu bölümden aktarım işlemi ile Muhasebe Modülüne aktarılır.