Sistem İşletmeni, firmaların açıldığı, çalışma dönem tanımlarının yapıldığı, kullanıcı, rol, grup ve terminallerin tanımlandığı ve kullanıcı bazında program kullanım yetkilerinin belirlendiği bölümdür. Buna göre Sistem İşletmeni bölümünde yapılabilen işlemler şunlardır:
- Firma tanımları kaydedilir.
- Dönem tanımları kaydedilir.
- Firmanın değişik merkezlerdeki işyeri, bölüm ve ambar tanımları kaydedilir.
- Terminallerde çalışan kullanıcılar ve bağlı oldukları grup tanımları kaydedilir.
- Programın değişik bölümlerinin kimler tarafından kullanılacağı belirlenir, yetkileri sınırlayarak gerek menü gerekse bilgilere ulaşımda güvenlik sağlanır,
- Yapılan işlemlerin kim tarafından ne zaman yapıldığı izlenir, performans değerlendirmesi yapılır.
- Doküman numaralama olanağı ile ticari sistemde yapılan işlemlerde kullanılan fişler için firmaya özel numaralama şablonları tanımlanır.
- Ticari işlemlerde kullanılacak adres, banka, taşıyıcı firma, vergi dairesi, gümrük bilgileri, sevkiyat yöntemleri ve ticari işlem gruplar tanımları kaydedilir.